V roce 1688 zde piaristé zřídili gymnázium. Klášter dnes slouží jako psychiatrická léčebna, po pražských Kateřinkách, druhá nejstarší v Čechách.

Kostel byl postaven v letech 1671–1673 podle plánů architekta italského původu F. Carratiho. Byl to jeden z prvních barokních chrámů na Mladoboleslavsku. Kostel je jednolodní s dvěma páry pravoúhlých kaplí, presbytářem a oratořemi. Hlavní oltář je z umělého mramoru podle návrhu G. Alliprandiho. Průčelí kostela zdobí znak zakladatele kostela Humprechta Černína s letopočtem 1674. V sakristii se nachází vchod do krypty, kam byli pochováváni členové piaristického řádu kláštera a kde bylo v roce 2010 nalezeno i srdce Heřmana Jakuba Černína, syna zakladatele. Říšský hrabě z Chudenic po otci zdědil nejen majetek ale i lásku k obci. Proto není divu, že se v intencích barokního myšlení rozhodl, že právě v Kosmonosích chce mít jednou pochováno své srdce, když tělo spočine vedle předků v chrámu sv. Víta v Praze.